Родился 3 сентября 1924 года в деревне Дубровке Хотинского района Могилевской области в крестьянской семье.
Отец — Пилипенко Корней Ефимович (1902 — 1981).
Мать — Пилипенко Серафима Анисимовна (1904 — 1939).
Супруга — Пилипенко Лариса Павловна (1928 г. рожд.).
Михаил Пилипенко 12 июля 1941 года вместе с отцом добровольно ушел на фронт. И спустя всего две недели прошел боевое крещение под Козельском. Там пришлось вступить в бой с авиадесантом врага. Схватка была дерзкой.
Немало тогда положили наши воины фашистов. Кое-кто из атаковавших авиадесант тоже пострадал. Был ранен и Михаил.
Едва вылечился, началась фронтовая жизнь: воевал на Западном, Калининском, Северо-Западном, Воронежском, Степном, 1-м Украинском фронтах.
Прошел такие суровые битвы, как Курская, за Днепр, Корсунь-Шевченковская. Вместе со своим 1318-м стрелковым полком 163-й стрелковой дивизии трижды форсировал Днепр. Сначала 25 сентября 1943 года напротив Киева через Матвеевский залив на Труханов остров. 27-29 сентября 1943 года — второе форсирование южнее Киева у села Бортничи через Жуков остров, где участвовал в освобождении поселка Чапаевка.
Затем 163-я стрелковая дивизия была переброшена в район севернее Киева. И там у пунктов Своромье и Лютеж эта дивизия в третий раз форсировала Днепр, захватив Лютежский плацдарм.
И все это время под огнем противника связист-разведчик Михаил Пилипенко обеспечивал связь с передовым отрядом 1318-го стрелкового полка. Не раз ему приходилось участвовать в отражении вражеских контратак.
В ходе освобождения Киева в районе Пуща-Водица фашисты прорвали линию фронта, и Михаил Пилипенко остался со своей радиостанцией в тылу врага. Когда ситуация приняла критический оборот, смелый, мужественный связист вызвал огонь на себя. И под грохот разрывов снарядов корректировал действия артиллеристов.
Указом Президиума Верховного Совета СССР за участие в форсировании Днепра, прочное закрепление на правом берегу и проявленное мужество в бою 29 октября 1943 года Михаилу Корнеевичу Пилипенко присвоено звание Героя Советского Союза.
После войны началась пора учебы. Вначале Пилипенко окончил Куйбышевское училище связи. Спустя несколько лет поступил в Военную академию связи и успешно ее окончил. В 1972 году прошел обучение на академических курсах.
В дальнейшем служил на различных должностях в Белорусском военном округе, в Академии связи, в Группе советских войск в Германии, на узле связи Генерального штаба.